在制造業特別是流程制造行業，批次管理是一種很常見的管理方式，其對生產制造的原材料、半成品以及成品（我們稱它們為料號）按照批號進行管理，同時，將庫房和加工現場的料號進行明確的批次標識并隔離存放。MES系統的批次管理功能板塊更好地實現制造業的信息化批次管理，同時貫穿于企業生產制造的整個流程。

批次管理的對象包括原材料、輔料、半成品和成品，涉及采購、加工、裝配等產品生產物流的全部過程。批次管理可以增加產品質量的可追溯性，增加質量的可控性，特別是對工藝參數的調整具有很大的幫助。
因此，為了更好地實現制造業的信息化批次管理，MES系統發揮了針對性的作用，具體如下：
1、批號的確定和分配。
幫助企業在材料采購入庫或產品生產入庫時，確定一個批次號并且分配給該批料號，這些批號可以選擇自動生成或手工錄入，同時，批號可以是無含義的代碼，也可以是帶有簡單的日期信息。
2、確定此批料號的特性
MES系統的批次管理利用事務記錄功能板塊確定該批料號所具有的具體屬性信息，如采購供應商是誰、供貨日期、檢驗記錄、企業內部生產單位、生產人員、生產日期等信息，成為企業業務信息的載體，包含最詳細的特性信息。
3、出庫批次的確定
MES系統的批次管理功能板塊幫助企業明確料號出庫時的批次，通過設置一些使用策略，如按照先進先出確定或者按供應商確定，設置一些批次號的查找規則，按照給定的條件檢索符合條件的批號。同時，料號出庫時能按規則確定出庫批次號，并且容許手工輸入。
4、批次檔案的建立
料號在進行入庫、庫房存放以及出庫使用的過程中均會產生一個批次號，MES系統的批次管理板塊會建立一種批次檔案數據，來進行反映批次的來源和去向，也便于后期的追溯分析。同時，批次檔案記錄也隨著系統事務數據的建立自動生成。
5、批次追溯分析
MES系統的批次管理功能板塊根據批次檔案來進行批次追溯分析，包括自上而下和自下而上的方式，也叫批次正查和反查。一方面，當銷售給客戶的產品發現質量問題時，會有銷售記錄查到發貨給該客戶產品的批次號，由該產品批次號在批次檔案中查到該批次產品的生產記錄，再由生產記錄在批次檔案中查到分別使用了哪些批次的材料，由材料批次號再查到采購記錄，由采購記錄可查到供應商。另一方面，當某批材料有質量問題時，同樣可以由批次檔案查到這批材料用到了哪些產品上，銷售給了哪些客戶。
　對于制造業來說，批次管理是一個復雜的管理問題，不僅增加了管理的難度和成本，而且也涉及到大量的數據記錄和查詢分析，因此，需要企業應用MES系統的批次管理軟件在各業務與各環節間支持批次管理，實現企業的信息化批次管理,進而優化企業的批次管理。